肛肠外科是丽水市中心医院重点发展的亚专科， 科室有8名专科医生，其中主任医师2名，主治医师4名，国际造口治疗师1名。开设肛肠外科门诊和造口门诊。科室配备STORZ公司全套高清腹腔镜设备、OLYMPUS电子结肠镜、肛肠熏洗仪、肛管直肠测压仪等；开展了排粪造影、结肠传输试验等。
目前已系统规范地开展了结直肠良、恶性肿瘤、痔疮、肛瘘、肛裂、便秘、直肠脱垂等常见病的治疗。在腹腔镜结直肠癌根治术、低位直肠癌保肛手术、痔疮PPH术、复杂肛瘘手术等方面与国内先进水平同步，在省内具有较高的影响力。建立了规范的肛肠外科无痛病房，将微创、无痛、快速康复外科理念应用到结直肠肛门疾病诊治中。
腹腔镜下直肠癌全直肠系膜切除术（TME）、保留盆腔自主神经（保存术后泌尿和性功能）超低位保肛直肠癌根治术、全结肠切除、回肠J型贮袋-肛门吻合术、腹腔镜下右半结肠癌全结肠系膜切除D3根治术、腹腔镜下直肠脱垂悬吊术、腹腔镜下骶前肿瘤切除术、痔疮的PPH术和痔动脉结扎术等。每年完成结直肠肿瘤手术250-300例；近期还开展了经肛全直肠系膜切除术（Ta-TME）、经自然腔道（阴道、直肠）取标本手术（NOSES），在全省处于先进水平。
结直肠多学科综合治疗团队（MDT）是浙江省内较早组建的肿瘤治疗团队，由肛肠外科、肿瘤内科、放疗科、消化科、病理科、影像科、介入科、造口师等专家组成；以规范化为原则，根据个体差异为各期结直肠癌，尤其是局部晚期、以及伴肝、肺转移的结直肠癌等患者讨论制定个体化治疗方案，确保每一位患者得到多个相关专科专家的共同会诊，以期取得最佳疗效。
